4种黑曲霉基因组DNA提取方法的比较

中国真菌学杂志　 2011, Vol. 6 　Issue (3): 145-148.

4种黑曲霉基因组DNA提取方法的比较

张晓利¹, 吕雪莲², 沈永年³, 吕桂霞³, 王淼淼⁴, 葛一平³, 刘维达³

1. 暨南大学临床医学博士后流动站, 广州, 510632;
2. 大连皮肤病医院, 大连, 116011;
3. 中国医学科学院皮肤病研究所, 南京, 210042;
4. 苏州大学第一附属医院, 苏州, 215006

收稿日期:2011-02-18 出版日期:2011-06-28 发布日期:2011-06-28
通讯作者: 刘维达,E-mail:liumyco@gmail.com E-mail:liumyco@gmail.com
作者简介:张晓利,女(汉族),在站博士后.E-mail:zx1415@hot-mail.com
基金资助:
科技重大专项(2008ZX10004-002);临床重点学科建设项目(2007-2009年度卫生部部属(管)医院临床学科重点项目(第7号));卫生部公益性行业科研专项经费项目(200802032)

Four methods of DNA extraction for Aspergillus niger

ZHANG Xiao-li¹, LV Xue-lian², SHEN Yong-nian³, LV Gui-xia³, WANG Miao-miao⁴, GE Yi-ping³, LIU Wei-da³

1. Clinical medicine postdoctoral mobile station of Jinan University, Guangzhou 510632;
2. Dalian Hospital for Diseases of the Skin, Dalian 116021;
3. Department of Mycology, Institute of Dermatology, Chinese Academy of Medical Sciemces & Pekinq Union Medical College, Nanjing 210042;
4. First Affiliated Hospital of Suzhou University, Suzhou 512006

Received:2011-02-18 Online:2011-06-28 Published:2011-06-28

摘要/Abstract

摘要： 目的筛选适合提取曲霉DNA的方法。方法比较2个菌落培养时间段(3 d内和10 d左右)提取DNA质量的差异;运用氯化苄法、石英砂+CTAB法、Biospin法和微波法分别提取黑曲霉基因组DNA,然后用直接电泳、浓度测定、PCR扩增等方法比较所提DNA的浓度和质量。结果培养3 d内的菌落提取的DNA纯度较高,无需纯化即可用于后续实验;4种方法制备的DNA均可用于PCR等后续实验,其中以石英砂+CTAB法提取的DNA纯度好,产率最高。结论石英砂+CTAB法是一种适用于曲霉DNA提取的简便方法。

关键词: 真菌, DNA提取, 比较

Abstract: Objective To find the best DNA extraction method for Aspergillus niger.Methods The purity and output of Aspergillus.niger DNA extracted by benzyl chloride method,CTAB method,Biospin kit and microwave method were compared via agarose gel electrophoresis and PCR.Results The extracted DNA cultured for 3 ds was purer than that for 7-14 ds.All the DNA products were amplifiable for PCR,but the purity and output via CTAB method showed the best results.Conclusions CTAB is suitable for Aspergillus niger DNA extraction.

Key words: fungi, DNA extraction, comparison

中图分类号:

R379.6

张晓利, 吕雪莲, 沈永年, 吕桂霞, 王淼淼, 葛一平, 刘维达. 4种黑曲霉基因组DNA提取方法的比较[J]. 中国真菌学杂志, 2011, 6(3): 145-148.

ZHANG Xiao-li, LV Xue-lian, SHEN Yong-nian, LV Gui-xia, WANG Miao-miao, GE Yi-ping, LIU Wei-da. Four methods of DNA extraction for Aspergillus niger[J]. Chinese Journal of Mycology, 2011, 6(3): 145-148.

[1]	丁翔宇, 贾晨虹, 张古英, 李倩, 刘艳辉. 普外科婴幼儿侵袭性真菌感染的高危因素分析与评分系统建立[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(6): 331-337,353.
[2]	李嘉利, 王鹏, 曾飞鹏. 红色毛癣菌致儿童阴囊、阴茎癣1例[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(6): 364-365.
[3]	朱红梅, 温海. 特比萘芬在皮下及深部真菌感染中的临床应用[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(6): 374-377.
[4]	刘瞳瞳, 杜琨. 施慧早产儿侵袭性真菌感染的危险因素[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(6): 381-384.
[5]	特比萘芬临床应用专家共识工作组. 特比萘芬临床应用专家共识[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(5): 257-261.
[6]	王玲, 景东云, 王学军, 刘俊, 曹月清. 长脉宽Nd:YAG 1064 nm激光治疗远端侧位甲下型甲真菌病的疗效观察及对真菌超微结构的影响[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(5): 268-273.
[7]	陈易鑫, 闫师玲, 朱银民, 范静平, 陈晓平, 周恩晖, 薛晓成, 张燚. 真菌性鼻-鼻窦炎的CT影像诊断分析[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(5): 283-287.
[8]	程颖, 陈丹. 儿童浅部真菌感染的临床分析[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(5): 288-292.
[9]	朱红梅, 温海. 特比萘芬在浅表真菌感染中的临床应用[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(5): 297-303.
[10]	赵静宇, 高杨杰, 甘厚婷, 陈润润, 顾菊林. 微课、慕课及翻转课堂在医学真菌学继续教育中的应用分析[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(5): 304-305.
[11]	步青云, 王润超, 罗亭, 卢昌佩, 景海霞. 甲真菌病的激光治疗新进展[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(5): 310-313.
[12]	李颖, 王贺, 张戈, 刘文静, 徐英春. Sensititre YeastOne显色药敏板与微量肉汤稀释法检测曲霉体外抗真菌药物敏感性的一致性研究[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(4): 197-201.
[13]	赵颖, 李志荣, 赵建宏, 栗方, 董爱英, 刘金禄, 郭彦言, 谢守军, 吴相锟, 郭秀华, 王建升, 张金艳, 刘冬青, 魏宏莲, 孙艳, 赵文申, 任宏涛, 郭映辉, 肖盟, 徐英春, 徐晓琳, 王军爽, 杨文航. 河北地区临床实验室丝状真菌分离鉴定情况分析[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(4): 206-212.
[14]	黄丽, 龚豪, 张春莲, 方彩云. 非妊娠妇女阴道真菌感染情况调查[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(4): 213-217.
[15]	刘小平. 216例感染性皮肤病几种病原体镜检方法对比[J]. 中国真菌学杂志, 2020, 15(4): 223-226.