利用微卫星标记研究新生隐球菌分子流行病学

中国真菌学杂志　 2011, Vol. 6 　Issue (5): 281-284.

利用微卫星标记研究新生隐球菌分子流行病学

潘炜华¹, 廖万清¹, 温海¹, 赵瑾¹, Ferry Hagen², Teun Boekhout²

1. 第二军医大学长征医院皮肤科上海市医学真菌分子生物学重点实验室, 上海200003;
2. 荷兰皇家科学院真菌多态性研究中心

收稿日期:2011-06-07 出版日期:2011-10-28 发布日期:2011-10-28
作者简介:潘炜华,女(汉族),博士,副教授.E-mail:panweihua@medmail.com.cn
基金资助:
国家自然科学基金(C30970130)

Study on molecular epidemiology of Cryptococcus neoformans species using microsatellite marker

PAN Wei-hua¹, LIAO Wan-qing¹, WEN Hai¹, ZHAO Jin¹, Ferry Hagen², Teun Boekhout ²

1. Shanghai Key Laboratory of Molecular Medical Mycology, Department of Dermatology, Changzheng hospital, Shanghai 200003, China;
2. CBS-KNAW Fungal Biodiversity Centre, Yeast and Basidiomycete Research, Utrecht, The Netherlands

Received:2011-06-07 Online:2011-10-28 Published:2011-10-28

摘要/Abstract

摘要： 目的研究国内隐球菌临床分离株的遗传多态性和分子流行病学。方法选择与新生隐球菌遗传相关的9个微卫星标记,分析这9个位点从1993～2009年国内分离到的新生隐球菌临床株遗传背景、来源及变异程度。结果 116株被研究的隐球菌临床分离株,主要归属于3个微卫星复合物(MC2,MC3和MC12),其中大部分为MC2(103株)。8株菌株属于目前为止未被国内外认识的新复合物(MC12)。结论利用微卫星DNA多态性研究新生隐球菌分子流行病学有较大的应用价值。

关键词: 新生隐球菌, 微卫星, 流行病学

Abstract: Objective To study the molecular epidemiology of clinical isolates of Cryptococcus neoformans in China.Methods Totally 116 clinical strains of Cryptococcus neoformans from 1993 to 2009 were isolated and the epidemiology was analyzed by microsatellite genotyping(STR).Results All the 116 strains of C.neoformans belonged to three microsatelite complexes(MCs),with the majority of MC2(n=103),and eight isolates belonged to an unknown microsatellite complex which was labeled as MC12.Conclusions STR is valuble in mocular epidemiological study on Cryptococcus neoformans.

Key words: Cryptococcus neoformans, microsatellite, epidemilolgy

中图分类号:

R379.5

潘炜华, 廖万清, 温海, 赵瑾, Ferry Hagen, Teun Boekhout. 利用微卫星标记研究新生隐球菌分子流行病学[J]. 中国真菌学杂志, 2011, 6(5): 281-284.

PAN Wei-hua, LIAO Wan-qing, WEN Hai, ZHAO Jin, Ferry Hagen, Teun Boekhout. Study on molecular epidemiology of Cryptococcus neoformans species using microsatellite marker[J]. Chinese Journal of Mycology, 2011, 6(5): 281-284.

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